Ja, det hjälpte! Jag kan se mina consist i Activity Editor igen!
När man förvissat sig om att det inte bara är så att man glömt ställa in starttiden (i AE Tools - Verify starting state) eller glömt att kryssa i något (i AE View-menyn) utan att consisten verkligen inte SYNS i AE så hjälpte följande procedur:
Windows Start > Kör > i fältet skriver man in "regedit" (utan citationstecken) och klickar "Ok" så öppnas den så kallade "Registereditorn".
I Registereditorns mappstruktur till vänster klickar man sig fram till:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Microsoft Games\Train Simulator\1.0\HWRenderer
Bland filerna i högra fältet finns filen AE_Normal_View.
Denna fil högerklickar man på och väljer "Ta Bort".
Starta om datorn. När man öppnar Activity Editor så finns consisten där som de ska.

Filen man tog bort återskapas automatiskt men med default-värderna. Tydligen beror de försvunna consisten på att värdet i AE_Normal_View ändrat sig.
En ominstallation av MSTS lär också fungera, likaså lär det finnas ett program som löser problemet, men lösningen ovan är nog den minst tidskrävande.
Lösningen hittade jag på
www.thetrain.de:s forum.